短期種子冷庫溫度控制15℃～20℃種子冷庫，相對濕度50%～60%，種子預期壽命2～5年。中期保存種子冷庫溫度控制在0℃～10℃范圍，相對濕度不大于60％，種子預期壽命10～30年。

種子冷庫根據貯存期的長短不同有不同的溫濕度要求。

1、短期種子冷庫用于保存生產性種子庫內溫度控制15℃～20℃種子冷庫，相對濕度50%～60%。種子容器從有紙袋、塑料袋、布袋、玻璃瓶等。種子含水量12%以下。種子預期壽命2～5年。

2、中期保存種子冷庫用于保存流動性種子，雪藝制冷專家建議種子庫溫度控制在0℃～10℃范圍，相對濕度不大于60％。種子容器與長期庫的相同。種子含水量6%～9%。種子預期壽命10～30年。

3、長期種子冷庫，用于長期保存種子，庫內溫度控制在在-10℃～-20℃范圍，相對濕度不大于60%。國際上對正常種子長期保存推薦的參考標準為-18℃或更低的溫度條件，種子含水量5±1%（以濕重為基礎）。封入不透氣的容器內，如密封的金屬盒、鋁箔袋、塑料復合薄膜袋、玻璃瓶等。種子預期壽命30～50年，或者更長時間。

種子貯藏是為農業生產提供可靠的物質基礎。經過對貯藏的雜交水稻、玉米種種溫及庫房溫濕度定期定點的觀察記錄分析表明，庫年平均溫度為11.2℃，平均相對濕度為63.8%。對貯藏種子的含水量、發芽率定期定點跟蹤兩年檢測結果表明：雜交水稻種子發芽率下降2.5%，雜交玉米種子發芽率下降4.0%，種子的含水量基本保持不變，貯藏種子的經濟效益顯著。